Nargile kömürü, geleneksel nargile keyfinin vazgeçilmez bir unsuru olarak bilinir. Genellikle odun kömürü, kokulu odun türleri veya kokusuz odun türlerinden elde edilen nargile kömürleri, tütünün yanmasını sağlamak ve dumanın oluşmasını tetiklemek amacıyla kullanılır. Bu kömürler, düşük kül ve yüksek ısı üreten özelliklere sahiptir, böylece nargile içerken uzun süreli bir keyif sunarlar.
Nargile kömürleri arasında öne çıkan türler arasında hindistancevizi kabuğundan üretilen kokos kömürleri, özellikle tercih edilenlerden biridir. Bu kömürler, çevre dostu olmaları ve düşük duman salınımına sahip olmalarıyla bilinir. Ayrıca, nargile kömürü seçimi kişisel tercihlere bağlı olarak değişebilir; bazı kullanıcılar odun kömürünün sağladığı geleneksel lezzeti, diğerleri ise kokusuz kömürlerin sunduğu temiz tütün tadını tercih edebilir. Nargile kültüründe kömür, tütünle birleşerek ritüel ve sosyal deneyimin bir parçası haline gelir, böylece kullanıcılar bir araya gelip keyifli anlar yaşarlar.